Nykyajan suodatusjärjestelmä lattian pölynimuri yleensä omaksuu monikerroksisen rakenteen. Ensimmäinen on ensisijainen suodatinkerros, joka on pääasiassa vastuussa suurempien pöly-, karva- ja roskahiukkasten sieppaamisesta. Se on kuin kiinteä puolustuslinja, joka estää suuria epäpuhtaushiukkasia pääsemästä suoraan myöhempään suodatusprosessiin, välttää vaurioittamasta herkempiä suodatuskomponentteja ja suodattaa myös alustavasti joitain ilman epäpuhtauksia vähentääkseen myöhemmän suodatuksen painetta.
Seuraavana on keskitehoinen suodatinkerros, jolla on korkeampi suodatustarkkuus kuin ensisijaisella suodatinkerroksella. Se voi vangita pieniä pölyhiukkasia ja joitain allergeeneja, kuten siitepölyä, pölypunkkeja ja muita pieniä aineita. Keskitehoisessa suodatinkerroksessa käytetään erikoiskuitumateriaaleja. Nämä kuidut on kudottu yhteen hienon suodatinrakenteen muodostamiseksi. Pölyhiukkaset adsorboituvat tai sieppaavat kuituja kulkiessaan läpi, mikä puhdistaa tehokkaasti ilmaa, vähentää hengitettävien hiukkasten pitoisuutta ilmassa ja suojaa käyttäjän hengitysterveyttä.
Tehokas suodatinkerros on koko suodatusjärjestelmän ydin. Yleiset tehokkaat suodattimet, kuten HEPA-suodattimet, voivat suodattaa pois erittäin pienet hiukkaset, kuten bakteerit, virukset ja jotkut haitalliset kemialliset hiukkaset. HEPA-suodattimella on erittäin korkea suodatusteho, ja se voi poistaa yli 99,97 % pienistä hiukkasista ilmassa. Periaate on, että monimutkaisen kuiturakenteen ja sähköstaattisen adsorption ansiosta pienet hiukkaset adsorboituvat lujasti suodatinkuidun pintaan kulkiessaan läpi, eivätkä pääse poistumaan ilmaan. Tällä tavoin pölynimurista poistuva ilma vähentää huomattavasti saastepitoisuutta ja muuttuu raikkaaksi ja puhtaaksi.
Suodatusjärjestelmän jatkuvan tehokkuuden varmistamiseksi joissakin pölynimuissa on myös automaattinen puhdistus tai muistutus suodattimen vaihtamisesta. Pölynimurin käytön aikana suodattimeen kertyy vähitellen pölyä. Jos sitä ei puhdisteta tai vaihdeta ajoissa, suodatusteho heikkenee, ilman raikkautta ei voida taata ja se voi jopa heikentää pölynimurin imutehoa. Automaattinen puhdistustoiminto voi ravistaa pois osan suodattimeen adsorboituneesta pölystä käänteisen ilmavirran tai tärinän avulla, mikä pidentää suodattimen käyttöikää; ja muistutus suodatintoiminnon vaihtamisesta voi viipymättä ilmoittaa käyttäjälle suodattimen käyttötilasta, jotta käyttäjä voi vaihtaa uuden suodattimen oikeaan aikaan säilyttääkseen suodatusjärjestelmän hyvän suorituskyvyn.
Lisäksi pölynimurin tiivisterakenteella on suuri merkitys ilman raikkauden takaamisessa. Hyvä tiivistysrakenne voi estää suodattamattoman ilman vuotamisen ja varmistaa, että kaikki sisäänhengitetty ilma käy läpi täydellisen suodatusprosessin, jolloin vältetään epätäydelliset puhdistukset ja ilmavuotojen aiheuttamat ilman saastumisongelmat.