Suodatusjärjestelmä Lattia-imuri sillä on ratkaiseva rooli toissijaisen saastumisen ehkäisyssä.
Laadukas Floor Vacuum Cleaner -suodatusjärjestelmä käyttää useita suodatustekniikoita. Yleisiä ovat ensisijainen suodatus, joka on yleensä suodatin tai suodatinpuuvilla, joka voi suodattaa pois suuret pöly- ja roskat, kuten hiukset, roskat jne. Tämä on ensimmäinen puolustuslinja toissijaista saastumista vastaan. Esimerkiksi joidenkin pölynimurien pääsuodatin voi tehokkaasti siepata paljaalla silmällä näkyviä suurempia hiukkasia, mikä vähentää myöhempien suodatuslinkkien taakkaa.
Seuraavana on tehokas suodatinkerros, kuten HEPA. Se pystyy suodattamaan tarkasti pienet pölyhiukkaset, ja 0,3 mikronin ja sitä suurempien hiukkasten suodatusteho voi olla jopa 99,97 % tai jopa korkeampi. Tämä tarkoittaa, että lähes kaikki pölynimuriin imeytynyt haitallinen pöly voidaan siepata, eikä sitä päästä enää ilmaan, jolloin vältetään sisäilman saastuminen ja ihmisen hengitysteiden vaurioituminen.
Jotkut pölynimurit käyttävät myös aktiivihiilisuodatinkerroksia, jotka voivat imeä hajuja ja haitallisia kaasumolekyylejä, kuten formaldehydiä ja bentseeniä. Erityisesti lemmikkieläinten karvoja, kosteaa ympäristöä tai hajuisia paikkoja puhdistettaessa aktiivihiilisuodatinkerros voi tehokkaasti poistaa hajuja, tehdä poistoilmasta raikkaampaa, parantaa puhdistustehoa entisestään ja estää hajujen ja haitallisten kaasujen aiheuttamaa toissijaista saastumista.
Lisäksi joidenkin huippuluokan lattiapölynimurien suodatusjärjestelmässä on myös itsepuhdistuva toiminto. Pölynimurin käytön aikana suodatinverkon pöly puhdistuu ajoissa käänteisellä ilmavirralla tai tärinällä, mikä säilyttää suodatinverkon läpäisevyyden ja suodatustehokkuuden sekä välttää suodattimen tukkeutumisen aiheuttaman imumäärän vähenemisen ja toissijaisen saastumisen. Esimerkiksi jotkin syklonierotustekniikalla varustetut pölynimurit voivat erottaa pölyn suodatinverkosta suodatusprosessin aikana voimakkaalla keskipakovoimalla ja pudottaa sen pölynkeräysastiaan, mikä varmistaa, että suodatusjärjestelmä on aina hyvässä toimintakunnossa.