Lattiapesurin automaattinen puhdistustoiminto puhdistaa tehokkaasti sen sisäisen harjan ja vesisäiliön. Tämä ominaisuus, joka on käytettävissä sen jälkeen, kun käyttäjä on siivonnut lattian, ylläpitää koneen puhtautta itsepuhdistusohjelman avulla. Erityisesti pesuri käynnistää automaattisesti puhdistusjakson ruiskuttamalla ensin puhdasta vettä tai erikoispuhdistusliuosta harjaan ja siihen liittyviin osiin. Tämä huuhtelee harjan perusteellisesti poistaakseen pölyn, hiukset, lian ja muut siihen kiinnittyneet jäämät. Automaattiseen huuhteluprosessiin kuuluu tyypillisesti harjan pyörittäminen, mikä tehostaa puhdistuksen perusteellisuutta.
Vesisäiliön osalta jotkut edistyneet lattianpesukone s puhdistaa sekä likavesisäiliön että puhtaan vesisäiliön samalla kun huuhtelee harjaa ja varmistaa, ettei jäämiä tai seisovaa vettä jää. Tämä estää hajujen tai bakteerien kertymisen ajan myötä.
Lisäksi jotkin kuivaustoiminnolla varustetut lattianpesurit suorittavat nopean harjalinkouksen vedenpoistoon, minkä jälkeen harja kuivaa kuumalla ilmalla pitäen sen kuivana. Tämä ei ainoastaan estä homeen kasvua kosteassa ympäristössä, vaan myös vesitahroja puhdistuksen jälkeen, parantaa hygieniaa ja pidentää laitteen käyttöikää.
Kaiken kaikkiaan lattianpesurin automaattinen puhdistusjärjestelmä on erittäin kätevä, ja se auttaa vähentämään käyttäjien huoltotaakkaa, pitämään koneen hyvässä toimintakunnossa ja pidentää sen käyttöikää.